Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
BC106179Q8C9L1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms