Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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