Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms