Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms