Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms