Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zfp398Q8BV16 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp398Q8BV16 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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