Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms