Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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