Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms