Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms