Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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