Protein–RNA interactions for Protein: Q80TN7

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Predictions only

Length 2,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav3Q80TN7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nav3Q80TN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nav3Q80TN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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