Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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