Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms