Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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