Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynmQ70IV5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynmQ70IV5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms