Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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