Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trak1Q6PD31 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms