Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms