Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms