Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms