Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms