Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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