Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms