Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms