Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms