Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trim24Q64127 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms