Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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