Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Taf6Q62311 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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