Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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