Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms