Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms