Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms