Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep250Q60952 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cep250Q60952 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cep250Q60952 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms