Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a3Q5XF89 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms