Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms