Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim58Q5NCC9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim58Q5NCC9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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