Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eme2Q56A04 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eme2Q56A04 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms