Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdv3Q4VAA2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms