Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms