Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp235Q499D5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp235Q499D5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp235Q499D5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms