Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms