Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms