Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rmi2Q3UPE3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rmi2Q3UPE3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms