Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp6Q3U6U5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp6Q3U6U5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms