Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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