Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms