Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itgb8Q0VBD0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms