Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms