Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms